Kirby est la première véritable ville écologique. Les Supertrees, alimentés par l’énergie solaire, absorbent le CO2 et libèrent un air sain. Tout le monde est heureux Tobias Develle arrive et ouvre une usine qui déverse des déchets chimiques dans la rivière. Charlie et Molly deviennent les « Climate Kids » et sont déterminés à protéger la planète. Quand ils voient des poissons morts dans la rivière, ils décident de faire quelque chose. Ils doivent absolument stopper Tobias Devell.